دومین همایش بین المللی قرآن در اندیشه و سیره امام خمینی(س) با رویکرد اخلاق و اجتماع روز چهارشنبه ۲۰ اسفند ماه ۱۳۹۹ برگزار شد.

در این همایش پس از تلاوت قرآن و سرود ملی جمهوری اسلامی ایران، به ترتیب برنامه های زیر اجرا گردید:

۱- خیر مقدم و تقدیر و تشکر از مشارکت کنندگان در همایش توسط معاونت قرآن و عترت وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی

۲-پخش پیام تصویری از آیت الله جوادی در ارتباط با موضوع همایش و تبیین  رویکرد اخلاق و اجتماع که مورد تاکید این همایش قرآنی بود

۳-ارائه سخنرانی توسط دکتر نجفقلی حبیبی با موضوع:چگونگی استمرار و دائمی بودن احکام اجتماعی اسلام با توجه به تحولات روز

۴- ارائه سخنرانی توسط خانم دکتر اخوان صراف با موضوع:واگرایی تفسیرپژوهی معاصران از دیدگاههای امام خمینی (ره)

۵- ارائه سخنرانی توسط خانم مریم المقداد از کشور تونس با موضوع:القرآن الکریم فی فکر ومنهج الإمام الخمینی ^{( قدس)}

۶- ارائه سخنرانی توسط حجت الاسلام والمسلمین دکتر سید ابوالفضل موسویان با موضوع: پذیرش حکومت غیر مردمی مغایر با توحیدِ در طاعت در آموزه های قرآنی و تأثیر آن در کلام امام خمینی(ره)

۷- رونمایی از ۳ مجلد مجموعه آثار ارسالی به دبیرخانه علمی همایش توسط آیت الله سید حسن خمینی

۸- سخنرانی آیت الله سید حسن خمینی .

در مراسم مذکور، دکتر عبدالهادی فقهی زاده معاون قرآن و عترت وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی پس از بیان اینکه امام خمینی بزرگترین خادم قرآن کریم در عصر حاضر  بوده و دارای  بینش، منش و روش، قرآنی بود افزود:  «اگر مفاهیم ارزشمندی همانند استقلال، نفی سلطه بیگانه، دین‌ورزی خردمندانه، جهاد فی سبیل الله، انحراف ستیزی و قیام در راه خدا و نترسیدن از زر و زور مفاهیم کلیدی قرآن هستند؛ حضرت امام(ره) به مثابه شاگردی برجسته و عالمی بزرگ آنها را هم در عرصه نظر و هم عمل تجلی بخشید».

در این مراسم آیت الله سید حسن خمینی پس از قدردانی از عوامل  و ارگانهای مشارکت کننده در برگزاری همایش به برگرفتن روح و حقیقت کلام الهی تاکید نموده و بحث درباره قرآن در اندیشه حضرت امام(ره) را بحثی دامنه دار و پیچیده عنوان کرد . ایشان به برگزاری دوره سوم این همایش نیز تاکید و سفارش نمود.